肿瘤样本低?#20302;?#21464;检测
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肿瘤组织DNA低?#20302;?#21464;检测服务

实验目标:通过二代深度测序,了解肿瘤样本中各类低?#20302;?#21464;的位置、碱基变化和相对比例。

实验样本:各类肿瘤组织抽提的DNA、各类肿瘤石蜡样本抽提的DNA。不包括血液中的?#21355;?#32959;瘤DNA。

测序深度:每个被测区段,平均测序深度达到5k-20k;所有被测区段?#26657;?#26368;低测序深度达到200-800倍。

检测灵敏度:1%-5%的低?#20302;?#21464;可被有效检出。

总体样本要求

1、若样品为基因组DNA,要求:DNA浓度≥20ng/ul,体积>20ul。纯度OD 260/OD280 在1.8~2.0之间。

2、若分型样品为肿瘤组织,要求肿瘤细胞比例>10%,送样过程中请注意保持低温,防止DNA降解。提取DNA将收取DNA提取费。

3、?#31361;?#22312;寄送样品的时候,应在送样包裹中放置足量的冰袋,以减少在运输过程中因温度变化导致DNA降解的可能。

4、提供片段序列信息,被选区域可以是连续的基因组序?#26657;部?#20197;是独立片段或外显?#26377;蛄小?/span>

结果提供

1、实验报告,含实验材料与方法,所用引物序列等等

2、结果汇总和基本分析,各样本中存在的肿瘤突变,测序深度以及注释?#21462;?/span>

3、高级分析,公司可根据?#31361;?#38656;求对数据进行分析,需?#31361;?#25552;供参考文献依据。

 

 


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